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R基上的氨基羧基怎么求

来源:化工产品网-原创 发布时间:2024-01-04 02:38:11
R基上的氨基羧基怎么求

在R语言中,我们可以使用“stringr”包中的“str_split”函数来分割字符串。在分割氨基酸序列时,我们可以使用正则表达式来匹配氨基羧基。氨基酸序列中的氨基羧基是由一个氨基酸的羧基和另一个氨基酸的氨基组成的,因此我们可以使用正则表达式“(?<=.)”来匹配前面的氨基酸,使用“(?=.)”来匹配后面的氨基酸。例如,对于氨基酸序列“MAYGSQHPAR”, 我们可以使用以下代码来分割得到其中的氨基羧基:

```

library(stringr)

seq <- "MAYGSQHPAR"

split_seq <- str_split(seq, "(?<=.)(?=.)", simplify = TRUE)

```

执行以上代码后,我们可以得到一个包含每个氨基酸和氨基羧基的字符向量:

```

[1] "M" "A" "Y" "G" "S" "Q" "H" "P" "A" "R"

[2] "" "" "" "" "" "" "" "" "" ""

```

其中,空字符串代表氨基羧基。

通过以上的方法,我们可以在R语言中方便地求得氨基酸序列中的氨基羧基。


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